"sc.pp.filter_cells(adata, min_genes=200)\n", "sc.pp.filter_genes(adata, min_cells=3)" ...
"https://scanpy-tutorials.readthedocs.io/en/latest/pbmc3k.html\n", "wget http://cf.10xgenomics.com/samples/cell-exp/1.1.0/pbmc3k/pbmc3k_filtered_gene_bc_matrices.tar ...
私はMD, PhDで今は米国に留学中です。研究者としての業務は完全に細胞や動物や臨床検体を扱う仕事ですが、近年のバイオインフォマティクスの波に飲まれ、既存のパッケージを利用して、与えられたfastqデータから、シングルセル解析のfigの出力くらいまで ...